Переоформление лицензии на водопользование осуществляется специально уполномоченным государственным органом управления в области использования и охраны водных объектов в случае изменения условий водопользования и состояния поверхностного водного объекта, по инициативе водопользователя, при реорганизации водопользователя — юридического лица и иных случаях, предусмотренных законодательством.
Переоформление лицензии на водопользование является основанием для внесения соответствующих изменений в договор пользования водным объектом.